Un équipement hautement performant pour le séquençage d’ADN disponible au laboratoire de Duclos en Guadeloupe

15/05/2024

Le laboratoire de l’UMR Animal, santé, territoires, risques et écosystèmes (ASTRE) de Duclos vient d’acquérir un nouvel équipement qui va permettre de réviser largement à la hausse la capacité de surveillance et de contrôle des maladies animales, végétales et humaines.

Photo du Biomark X9 et plaques fluidiques © Cirad

Grâce à un financement Interreg Caraïbe, le projet Approche Une santé pour réduire les risques sanitaires dans les Caraïbes (AUSCAR) a permis d’acquérir une nouvelle génération d’équipement permettant de détecter les pathogènes, équipement qui pourra profiter à tous les partenaires de la Caraïbe ou d’ailleurs !

Micro-fluidique pour Macro-débit

En effet, le Biomark X9 permet de réaliser des PCR en temps réel, à haut débit et en point final pour détecter des pathogènes de manière beaucoup plus performante et impossibles à reproduire à l'aide d'autres systèmes PCR conventionnels. La nouvelle technologie, miniaturisée, réalise des milliers de réactions dans des volumes très petits (de l'ordre du nanolitre), sur un dispositif classique (de la taille d'une plaque à 96 puits conventionnelle) en un temps record. Elle améliore également la sensibilité pour le très haut débit, utile pour le génotypage, la caractérisation de l'expression génétique, la détection des variations dunombre de copies et les essais de présence/absence du génome.

Les avantages

Ce système complexe miniaturisé élimine de nombreuses étapes de pipetages individuelles, présente un faible risque de contamination et abouti à des résultats d’une grande fiabilité.

A quoi cela nous sert ?

Avec cet équipement, il est possible de rechercher tous les pathogènes éventuellement présents dans les tiques ou dans les moustiques, sur un grand nombre d’échantillons. D’autres applications pourront être développées comme le typage génétique, ou l’expression de certains gènes, à haut débit et de manière très fiable.