Epidémiosurveillance, biocontrôle des pathogènes des plantes cultivées et santé globale des écosystèmes : un nouveau chercheur en appui à Madagascar

07/10/2025
Les maladies des plantes et les bioagresseurs représentent une menace importante pour l’agriculture familiale dans un contexte où la sécurité alimentaire est un enjeu majeur. Afin de surveiller ces maladies et attaques et de limiter leur propagation, des projets du Cirad dont Dinaamicc et Epibio 2 se penchent spécifiquement sur le développement de solutions de biocontrôle contre ainsi que sur l’épidémiosurveillance des maladies des cultures dans la région de l’océan Indien, avec une prise en compte de la dimension environnementale dans l'étude de la résistance aux antibiotiques dans un contexte de santé globale. Dans le cadre de la mise en œuvre des activités de ces projets, Adrien Rieux, spécialiste de l’évolution de la diffusion et de la gestion des microbes pathogènes, rejoint la Direction régionale du Cirad, renforçant ainsi l’équipe travaillant sur la santé globale des écosystèmes. Découvrons son parcours et ses missions à Madagascar.
Adrien RIEUX, lors d’une mission du projet Epibio-2

Adrien RIEUX (ici à gauche sur la photo) lors d’une mission du projet Epibio-2 dans la région de Boeny en 2024 accompagné de collègues du CIRAD, du FOFIFA et d’organisations paysannes. © A.RIEUX, Cirad

Adrien avec son équipe

Adrien RIEUX avec son equipe © Yannick Ah-Hot

Chercheur Cirad de l’UMR PVBMT - Peuplement végétaux en milieu rural, Adrien Rieux a rejoint la direction régionale du Cirad à Madagascar en Septembre 2025. Il est accueilli au sein du Département de Recherches Agronomiques (DRA) du Fofifa, partenaire de longue date de l’UMR PVBMT et du Cirad à Madagascar. Généticien des populations de formation, Adrien possède 10 années d’expériences sur l’étude et la gestion des pathogènes des cultures dans l’Océan Indien. Ses travaux se situent à l’interface des dispositifs en partenariat (dp) Biocontrôle-OI & One Health-OI. 

Veille épidémiologique au service des cultures : surveiller pour mieux protéger dans l’océan Indien

Dans le cadre du projet Epibio-2, Adrien contribuera à : 

  • i) la cartographie et la surveillance des bioagresseurs émergents et des maladies dans les différentes îles de la région (voir pour exemples ces travaux précédents sur le chancre des agrumes, la bactériose du riz ou encore le virus des taches annulaires de la vanille à Madagascar),
  • ii) le développement de solutions innovantes de diagnostic, notamment grâce à des outils moléculaires tels que la LAMP-PCR et le séquençage à haut débit et
  • iii) la formation des laboratoires régionaux à l’utilisation de ces approches afin de renforcer les capacités locales de réponse aux menaces phytosanitaires.

Biocontrôle : innover avec la nature pour lutter contre les maladies des plantes

Arrivé A.Rieux

© A.RIEUX, CIRAD

Dans le cadre des projets Dinaamicc & Epiphages-OI, il accompagnera le développement de solutions de biocontrôle basé sur l’utilisation de microorganismes endémiques (champignons et virus) pour lutter naturellement et efficacement contre deux grands ravageurs des cultures à Madagascar : la chenille légionnaire Spodoptera frugiperda s’attaquant aux cultures de maïs et le complexe d’espèces bactériennes Ralstonia solanacearum causant le flétrissement de nombreuses solanacées (pomme de terre, piment, tomate, aubergine…).

Antibiorésistance et environnement : une approche One Health pour comprendre et agir

Depuis plusieurs années, Adrien étudie les processus associés à l’émergence et la diffusion des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les agroécosystèmes de la région, comme illustré par ces travaux publiés en 2023 et 2025 en collaboration avec l’Institut Pasteur de Madagascar (IPM). Alors que la majorité des recherches se sont jusqu’à présent concentrées sur les milieux cliniques et vétérinaires, Adrien prévoit de se pencher sur le compartiment environnemental (sols, plantes, fruits & légumes, eaux…) encore largement sous-exploré dans la région.