Les micro-organismes, bactéries fixatrices d'azote et champignons mycorhiziens, qui vivent en symbiose avec des espèces végétales, jouent un rôle essentiel dans l'accroissement et le maintien des productions agricoles et forestières, mais aussi dans la régénération des environnements tropicaux et méditerranéens. Ils permettent de mettre en place des stratégies de développement durable et de réhabilitation des écosystèmes dégradés et menacés.
Les objectifs scientifiques de l'unité sont de caractériser, d'analyser et d'exploiter la diversité des associations symbiotiques et rhizosphériques dans les relations plantes - micro-organismes. Sur le plan fondamental et dans le domaine de la formation, il s'agit de caractériser, chez quelques modèles microbiens et végétaux, les mécanismes moléculaires impliqués dans le fonctionnement et l'évolution de ces associations. Sur le plan des applications et de la valorisation, l'objectif est de proposer des méthodes susceptibles d'intéresser directement les entreprises du domaine des biotechnologies.