Cette organisation est explicitée dans un manuel d'assurance qualité disponible à la demande.

En effet, sensible depuis toujours à la rigueur et à la traçabilité des analyses réalisées, le laboratoire a, depuis 1991, progressivement adopté le cadre d'un système d'assurance qualité : organigramme de la structure, implication de tout le personnel, modalités d'acquisition des équipements, suivi des procédures opérationnelles et d'instruction, vérification du matériel de mesure, contrôle et enregistrement des analyses, audits internes, formation des agents, analyse des dysfonctionnements et mise en place d'actions correctives appropriées...

La justesse des résultats d'analyse est assurée par le passage systématique d'échantillons de référence et la participation permanente à des enquêtes inter-laboratoires nationales (Bureau interprofessionnel d'études analytiques - BIPEA) ou internationales (International Soil Exchange - ISE, International Plant exchange - IPE, Comité inter instituts - CII). Les résultats de ces contrôles, ainsi que d'autres indicateurs de qualité, sont régulièrement portés à la connaissance du personnel.

Outre la réalisation d'analyses, cette reconnaissance externe d'organisation par l'Afaq englobe désormais 3 autres domaines d'activités du laboratoire :

• Le transfert de connaissances
• L'adaptation de méthodes
• L'expertise

Le laboratoire est agréé par le ministère de l'agriculture pour les analyses de terre de types 1 (physico-chimie), 2 (granulométrie), 3 (éléments traces) et 4 (reliquats azotés).

Le laboratoire est agréé par le Service Régional de la protection des végétaux (SRPV) pour l'importation des terres d'origine non européennes.