L’unité étudie dans les agro-écosystèmes les évolutions conjointes du fonctionnement des plantes et du sol sous les effets des changements globaux et des pratiques agronomiques. Les recherches proposent, sur la base de connaissances scientifiques, des pratiques dédiées au maintien et à l’amélioration des fonctions agricoles et environnementales des agro-écosystèmes.
Les travaux de l’UMR visent à décrire, comprendre et prévoir les processus écologiques de la production primaire et de la régulation des flux de carbone, de gaz à effet de serre et de nutriments. Dans une démarche d’écologie fonctionnelle, l’UMR étudie le rôle des organismes du sol et des plantes et de leurs interactions dans les cycles biogéochimiques au sein des sols et des agro-écosystèmes. L’étude des régulations biologiques et des flux couplés de carbone, d’eau et de nutriments s’appuie sur la modélisation, l’observation à long terme sur le terrain, l’expérimentation in situ et l’expérimentation en conditions contrôlées. Les milieux étudiés sont principalement les agro-écosystèmes méditerranéens et tropicaux à faibles intrants.