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  • Reconstituer la croissance de méristèmes à partir de l’imagerie cellulaire

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Reconstruction numérique tridimensionnelle d’un méristème floral (Arabidopsis thaliana) observé en microscopie confocale. Les cellules ont été segmentées automatiquement à l’aide d’une chaîne de traitements algorithmiques.

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Reconstruction numérique tridimensionnelle d’un méristème floral (Arabidopsis thaliana) observé en microscopie confocale. Les cellules ont été segmentées automatiquement à l’aide d’une chaîne de traitements algorithmiques. On observe la segmentation à l’intérieur des tissus, montrant les différentes couches cellulaires en fausses couleurs.

Partenaires

  • Ecole nationale supérieure de Lyon (ENSL)
  • Institut national de recherche en informatique et automatique (Inria)
  • Institut national de la recherche agronomique (Inra)
  • Région Languedoc-Roussillon
  • Agence nationale de la recherche (ANR)

En savoir plus

Fernandez R. et al., 2010. Imaging plant growth in 4D: Robust tissue reconstruction and lineaging at cell resolution. Nature Methods, 7 : 547-553.

Contact

Christophe Godin
Montpellier
Amélioration génétique et adaptation des plantes (UMR Agap)

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Reconstituer la croissance de méristèmes à partir de l’imagerie cellulaire

06/2011

Deux équipes du Cirad et leurs partenaires viennent de montrer qu’il est possible d’automatiser la reconnaissance des cellules de méristème.

Deux équipes du Cirad et leurs partenaires viennent de montrer qu’il est possible d’automatiser la reconnaissance des cellules de méristème, un groupe de cellules produisant tous les organes de la plante, en trois dimensions et de suivre leur division et leur croissance au cours du temps, à partir d’images en microscopie laser et d’algorithmes appropriés. Ce travail, réalisé dans le cadre d’une étude sur la croissance des méristèmes végétaux à l’échelle tissulaire, se situe à l’interface de l’imagerie cellulaire et du traitement mathématique de l’image. Il représente un progrès sensible pour toute la communauté des biologistes car il lève un verrou majeur sur le chemin de la compréhension du développement des organismes végétaux et du rôle de la composante cellulaire dans la croissance et l’acquisition de la forme définitive des organes. Les applications potentielles de cette nouvelle méthodologie sont nombreuses, notamment pour l’étude de l’influence de l’environnement et de la génétique sur le développement des plantes.


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