Diagnostic moléculaire pour la détection précoce des virus de l'influenza aviaire de type A et de la maladie de Newcastle

L'objectif général du cours est d'apporter une formation pratique en diagnostic moléculaire de l'influenza aviaire et de la maladie de Newcastle et d'enseigner différents protocoles et procédures de RT-PCR traditionnelles ou en temps réel. Cette formation inclura des protocoles et des procédures standardisés ainsi que des modes d'emploi d'équipements et de diagnostics.

Les objectifs spécifiques sont les suivants :

• formation en diagnostic moléculaire de l'IAHP et de la MN ;
• connaissance de différents protocoles de RT-PCR ;
• connaissance de différents protocoles de rRT-PCR ;
• informations sur le typage moléculaire et l'analyse phylogénétique de l'IAHP et de la MM.

A la fin de la formation, les participants seront capables d'établir des méthodes de diagnostic, de former et de suivre en permanence le personnel de laboratoire.

Le virus de la maladie de Newcastle (MN) et le virus de l'Influenza de type A sont responsables de pertes sérieuses dans l'industrie volaillère. L'Influenza aviaire hautement pathogène (IAHP), connu sous le nom de grippe aviaire et causé par le sous-type H5N1 d'origine asiatique est une menace publique et économique pour de nombreux pays en Asie, Afrique, Moyen-Orient et Europe et pose un risque sérieux pour la santé humaine. La détection précoce de l'IAHP ou de la MN est essentielle pour un contrôle rapide de ces maladies. De nombreuses méthodes peuvent être utilisées pour cette détection mais le diagnostic moléculaire par transcription inverse suivie par la réaction en chaîne de la polymérase (RT-PCR) est la méthode la plus rapide, la plus sensible et la plus spécifique. La RT-PCR est une méthode qui peut amplifier des séquences spécifiques d'acides nucléiques viraux pour réaliser un diagnostic précis. Deux techniques différentes peuvent être utilisées : la procédure conventionnelle qui nécessite plusieurs étapes et une nouvelle technologie appelée RT-PCR en temps réel (rRT-PCR) qui donne des résultats en un temps plus court. Le séquençage du site de clivage inclus dans la région amplifiée du gène de l'hémagglutinine est recommandé pour l'identification des souches pathogènes et pour le suivi épidémiologique des virus isolés. Afin d'être réalisés correctement, ces tests moléculaires nécessitent du personnel spécialisé, des protocoles et des équipements particuliers.

La formation sera organisée et coordonnée par l'unité de recherche Contrôle des maladies animales exotiques et émergentes du Cirad, Montpellier. Le programme alternera des présentations théoriques et des sessions de travaux pratiques. La première semaine sera focalisée sur la PCR conventionnelle et la seconde semaine s'intéressera à la PCR en temps réel.

Ci-joint un questionnaire Formation influenza à remplir

Les participants doivent être impliqués de manière active dans le diagnotic des maladies animales et posséder une expérience en biologie moléculaire. Une connaissance théorique minimale de la PCR est requise.