Maladies émergentes : surveiller pour mieux contrôler

Comme l’expliquent les chercheurs : « les maladies animales émergentes sont en constante progression et, parmi elles, les zoonoses qui représentent des risques sérieux pour les sociétés humaines du Sud et du Nord ». Certaines de ces maladies qui font l’objet de nombreux travaux du Cirad, sont dites emblématiques tant elles atteignent de manière récurrente animaux et territoires géographiques.

La surveillance

Le Cirad a une longue tradition de recherches sur la prévention des risques sanitaires qui fragilisent les Pays du Sud. Les risques liés à l’animal sauvage et domestique sont ainsi identifiés et évalués au travers de dispositifs de surveillance. Sur la base de modèles et de scénarios, sont expérimentés des outils intégrés de prévention, de gestion et d’intervention pour surveiller, prévenir et limiter les causes et les conséquences de ces risques.

Pour ce faire, sont privilégiées :

- une approche « analyse de risque » qui s’intéresse aux conséquences épidémiologiques et socio-économiques d’une maladie sur les populations animales et humaines, les systèmes, les filières en y intégrant les aspects de prévention et de gestion. Sont par exemple étudiées les contraintes ou motivations pour un éleveur à déclarer aux autorités sanitaires, la maladie de ses animaux (influenza aviaire au Vietnam).

- une approche « écologie de la santé » qui se focalise sur le fonctionnement de systèmes ou de communautés incluant des populations humaines et d’animaux sauvages et domestiques au sein desquels circulent des agents pathogènes.

A la demande de la FAO ou de l’ OIE, l’équipe AGIRs organise également très régulièrement des formations à destination des agents des services vétérinaires dans différentes régions du monde. Ces formations ont notamment pour but de permettre aux acteurs d'un réseau d’épidémiosurveillance, de fournir des outils mieux collecter, gérer et traiter les données issues de l'épidémiosurveillance. Des outils spécialement destinées aux formations ont par ailleurs été développés (voir Ranema et Ranema-FLU sur le dispositif d’enseignement en ligne du Cirad).

Quelques exemples d’application

Mieux comprendre l’épidémiologie d’une maladie pour proposer des mesures de surveillance et de contrôle adaptées

• La peste porcine africaine (PPA) touche les porcs et les suidés sauvages, les sangliers en Europe et en Afrique, les phacochères et potamochères. Elle se transmet par contact entre les animaux malades et sains. Les menaces d’introduction sont fortes en Europe (Corse et Sardaigne) mais aussi en Asie.

Les résultats obtenus par le Cirad (identification de déterminants écologiques, épidémiologiques et socio-économiques de la maladie, évaluation des risques d’introduction et de diffusion, perception de la maladie par les éleveurs) qui étudie depuis plusieurs années la PPA, permettent de mieux définir les stratégies de surveillance et de contrôle en ciblant les populations et écosystèmes à risque.

Evaluer les risques d’introduction ou d’extension géographique d’une maladie

• La fièvre de la vallée du Rift (FVR) est une zoonose (maladie transmissible de l’animal à l’homme) qui atteint de nombreuses espèces (ovins, moutons, chameaux et chèvres). La transmission entre animaux se fait par les piqûres de moustiques infectés. La FVR sévit en Afrique mais aussi en Arabie saoudite et au Yémen. Elle représente une menace pour l’Eurasie.

Le Cirad mène des travaux sur les mécanismes de transmission de la fièvre de la vallée du Rift dans plusieurs pays touchés par cette maladie (Madagascar, Afrique australe), mais aussi dans des pays encore indemnes afin d’évaluer les risques d’introduction (en Thaïlande par exemple). Grâce aux réseaux qu’il a mis en place, il peut évaluer les risques de progression et surtout proposer des recommandations de gestion des risques afin d’éviter sa propagation.

Evaluer les risques d’émergence d’une nouvelle maladie pour mieux la prévenir

• Les chauves souris qui représentent le second plus grand ordre de mammifères avec plus de 930 espèces identifiés. Elles sont, de part leur diversité et leur capacité à voler (unique chez les mammifères), des acteurs importants dans le maintien et la transmission d’agents infectieux dans les écosystèmes. Elles jouent par conséquent un grand rôle dans l’émergence de maladies chez les animaux comme chez l’homme (la rage, les encéphalites, les fièvres hémorragiques Ebola et Marburg, etc.).

Le Cirad en partenariat avec le CIRMF (Centre international de recherches médicales de Franceville) et L’ IRD effectue actuellement au Gabon des recherches sur les chauves-souris cavernicoles et leur rôle de réservoirs de pathogènes potentiellement dangereux pour l’homme. L’objectif du projet de recherche est de déterminer quels sont les risques sanitaires liés à la présence de chiroptères pour les populations humaines locales habitant à proximité des grottes où vivent d’énormes populations de chauves souris ; quels sont les mécanismes de maintien et de transmission des pathogènes au sein de communautés cavernicoles et quels sont les déterminants et les facteurs d’émergence d’une maladie et/ou l’apparition d’une épidémie ? En Asie du Sud-est, suite aux épidémies successives liées au virus Nipah chez l'homme et le porc domestique, le Cirad développe une collaboration avec l’ Institut Pasteur du Cambodge et l' université de Mahidol en Thaïlande sur le modèle Nipah-Chauves souris pour estimer les risques et les facteurs d'émergences de cette maladie dans le sud-est asiatique.

Développer des méthodes permettant une meilleure évaluation des systèmes de surveillance de l’influenza aviaire

• La grippe aviaire persiste dans plusieurs pays et la Fao estime que «l'élimination chez les volailles du virus hautement pathogène H5N1 de l'influenza aviaire dans les six pays où il demeure endémique prendra au moins dix ans ». Les pays concernés sont essentiellement en Asie, et en Egypte pour le continent africain. Les virus influenza chez les oiseaux ainsi que ceux affectant les porcs domestiques sont à placer sous haute surveillance afin d’évaluer également les risques de transmission à l’homme.

Le Cirad mène en Asie du sud-est le programme REVASIA dont l’objectif est de développer des méthodes innovantes d’évaluation des performances épidémiologiques et socio-économiques des systèmes de surveillance. Ces travaux seront développés par ailleurs en Egypte. Ces approches s’inscrivent également dans le contexte One Health Initiative qui étudie l’interface de l’animal et de l’homme en analysant en particulier les liens entre les systèmes de santé animale et publique. Trois présentations de ce programme se dérouleront à l’ICAHS (voir ci-après).

Le Cirad à l’ICAHS

Les chercheurs de l’Unité de recherche Animal et Gestion Intégrée des Risques (AGIRs) exposeront des posters et effectueront cinq présentations orales à la conférence internationale ICAHS :

- Dimensionnement et comparaison des différents systèmes de surveillance de la fièvre du Nil occidental dans un contexte européen en évolution (Véronique Chevalier)

- Systèmes de surveillance formels et informels : comment établir des passerelles ? (Stéphanie Desvaux)

- Évaluation des systèmes de surveillance épidémiologique en santé animale : nécessité d’adapter les outils au contexte des pays en développement, résultats d’un colloque régional en Asie du sud-est (Marisa Peyre)

- Évaluation du système de surveillance de la grippe aviaire H5N1 dans les élevages de volailles en basse-cour et en plein air en Thaïlande (Flavie Goutard)

- La méthode de capture-recapture comme outil d’évaluation de la surveillance des maladies animales : l’exemple de la fièvre aphteuse au Cambodge (Timothée Vergne)

François Roger présidera également une session. Sophie Molia, et Flavie Goutard participeront à un atelier sur la terminologie utilisées en épidémiosurveillance et à une table ronde durant la conférence tandis qu’une formation relative aux techniques de capture-recapture en surveillance épidémiologique, animé par Vladimir Grosbois et Timothée Vergne, prendra place à l’Ecole Normale Supérieure de Lyon, le 16 mai.