3e colloque Epizone sur les maladies animales épizootiques : vers une information génétique partagée

Créé en juin 2006, le projet Epizone relève du 6e programme cadre de recherche et développement (PCRD) de la Commission européenne, sur un budget de 14 millions pour une durée de cinq ans. Ce réseau scientifique coordonné par le Centraal Instituut voor Dierziekte Controle de Lelystad (Pays-Bas) réunit 19 instituts partenaires dont 300 chercheurs qui travaillent dans quatre grandes directions :
- diagnostics ;
- stratégies d'intervention ;
- surveillance et épidémiologie ;
- évaluation des risques.

«Enseignement et Formation » et « Epidémiologie Moléculaire » , tels sont les programmes de travail coordonnés par le Cirad. L’objectif de cette dernière thématique est de donner accès à l’ensemble de l’information génétique des génomes microbiens pour le développement de l’épidémiologie. Le séquençage complet a considérablement augmenté en puissance d’investigation et les méthodes bioinformatiques permettent maintenant de comparer les séquences génomiques complètes de plusieurs souches d’une même espèce, entre elles et avec celles d’autres espèces d’organismes proches.

A terme, une banque de données sera accessible à tous les chercheurs du réseau et permettra d’identifier les pools de gènes d’intérêt (gènes de virulence, gènes codant des protéines impliquées dans l’adhésion aux cellules cibles, le transport etc.) qui sont autant de cibles vaccinales voire thérapeutiques pour lutter contres les agents de maladies telles que l’Influenza aviaire, la Fièvre Catarrhale Ovine (FCO), la Peste des Petits Ruminants, la Peste Porcine Africaine (PPA), la Péripneumonie Contagieuse Bovine (PCB), la fièvre aphteuse, la fièvre de la vallée du Rift.

En outre, le Cirad va mettre en place dès le mois de mars 2009 un essai inter-laboratoires pour le virus de la peste des petits ruminants à l’aide des méthodes sérologiques Elisa et moléculaires PCR pour lesquels des réactifs tels que sérums et souches virales seront distribués aux partenaires de l’opération. Un des thèmes d’EPIZONE « Diagnostic » est en effet dédié au développement et à la standardisation des outils de diagnostic pour les maladies épizootiques.

Aussi des essais inter-laboratoires sont-ils mis en place régulièrement dans le cadre du réseau « aux fins de parfaire la capacité diagnostique des laboratoires pour telle ou telle maladie», comme le précise Geneviève Libeau, chercheur au Cirad, qui figure parmi les quatre scientifiques de renommée internationale invités comme conférencier au colloque. Elle présentera deux conférences sur la peste des petits ruminants et ses récents développements au Maghreb.

Quinze chercheurs du Cirad participeront également au meeting annuel d’Antalya sur les sujets suivants :
- revue des tests inter-laboratoires organisés au sein d’Epizone et perspectives de standardisation,
- caractérisation moléculaire des virus virulents de la Maladie de Newcastle isolés au Mali en 2007 et 2008,
- mise au point d’une RT-PCR multiplex “one-step” pour la détection et le sous-typage des virus de l’influenza humain et aviaire H1, H3, H5, H7, N1, N2,
- identification du virus de la peste des petits ruminants dans les foyers de maladie au Maroc en 2008,
- première incursion de la peste des petits ruminants au Maroc,
- mise en évidence d’une circulation récente du virus de la Fièvre de la Vallée du Rift à Mayotte, une île française de l’Océan indien.